Aufbau und Pflege eines umfassenden Umwelt-Überwachungsprogramms gewinnen in der modernen Lebensmittelindustrie immer weiter an Bedeutung. Programme zur effektiven Überwachung und Verwaltung von Bereichen mit mikrobiologischen Risiken innerhalb von Produktionsanlagen können als „Frühwarnsysteme“ zur Identifikation und Beseitigung potentieller Kontaminationen fungieren. Ein gutes Umweltüberwachungsprogramm muss durch Tests sicherstellen, dass Reinigungsprozeduren Indikatororganismen sowie jegliche Organismen, die besondere Aufmerksamkeit erfordern, unter Kontrolle halten.